当代佛教界著名的圣严法师对于密教密宗是完全持否定态度的。其所著《印度佛教史》中对于密宗所全盘继承的印度晚期佛教──密教作了正确的评断，该书“第十二章从密教盛行到近代佛教”：
现在，我们先说初期的杂密，杂密是没有教理可说的，它的原始成分，大多来自婆罗门教。……佛教成为密教，可谓是突如其来，也可谓是渊远流长。所谓突如其来，因在释尊的时代反对神秘，否定神权，破斥方技之术，一切咒语术数之学均非释尊所喜。《长阿含经》卷一四第二十一经《梵动经》所载：“如馀沙门婆罗门，食他信施，行遮道法，邪命自活。召唤鬼神，或复驱遣，种种祷，无数方道，恐热于人，能聚能散，能苦能乐……或为人咒病，或诵恶咒，或诵善咒……或咒水火，或为鬼咒，或诵刹利咒，或诵象咒，或支节咒，或安宅符咒，或火烧、鼠、能为解咒，或诵知生死书，或诵梦书，或相手面，或诵天文书，或诵一切音书，沙门瞿昙无如此事。”
……总之，密咒发源于婆罗门教，佛陀最初禁绝，继而由于外道来佛教中出家的人渐多，他们习用咒语治病。至部派佛教如法藏部，推尊目犍连，盛说鬼神，咒法渐行。到了大乘密教，更进而以密咒哲学化，完成了高深的理论基础。密咒之能产生效验，那是无可置疑的，若言观诵真言而能即身成佛，此所成之佛，是何等性质之佛？则尚有考察的馀地。
……根据密教的传说，密教是由大日如来，传金刚萨，金刚萨成为付授密法的第二祖。释尊灭后八百年，有龙树（龙猛）出世，开南天铁塔而亲向金刚萨面受密乘，为第三祖。龙树传其龙智，为第四祖。再过数百年，龙智七百岁，传付第五祖金刚智。金刚智便是唐玄宗开元年间来华的开元三大士之一。
然经历史的考证，由龙树开南天铁塔，是密教学者附会龙树入龙宫得大乘方等深奥经典的传说，托古自重。……
多罗那他的《印度佛教史》也说，密教通途均以龙树为源头，此龙树乃系出于婆罗门罗罗跋陀罗之下，但此罗罗跋陀罗又被学者疑为提婆之讹传；龙树将密乘下传龙智，胜天的流波又尝学于龙智之门，胜天则为稍后于的人。又有月称的护足，也曾从龙智求学。因而就有人传说龙智寿长七百岁了。
但据《密教发达志》卷三所说，金刚智的师承是师子国的宝觉阿梨，不是龙智。又据吕澄的《佛学原论》中说：“综合各事观之，彼传密乘之龙树者，其师罗罗，似出提婆之后，其弟龙智，又在胜天月称之前，或即提婆月称之间，有此一家，而与创弘大乘之龙树别为一人也。”
所谓左道密教，是对以《大日经》为主的纯密或右道密教而言。……此在《诸部要目》中说：“佛部，无能胜菩萨以为明妃；莲华部，多罗菩萨以为明妃；金刚部，孙那利菩萨以为明妃。”为了表征悲智相应，部主均有女尊为偶，修法者付之实际，便是行的男女双身的大乐。后来，遂以金刚上师为父，以上师之偶及一切修密法的女性为空行母，竟至将上师修双身法而遗的男精女血为甘露、为菩提心。佛教本以淫欲为障道法，密教的最上乘却以淫行为修道法。由中国而传到日本的密教，仅及于金刚界及胎藏界的纯密，未见到最后的无上瑜伽之行法，所以日本学者称它为左道密教。
正由于两身相交的行法之开演，接着就出现了多种象征的名词。以男子生殖器称为金刚杵，以女子生殖器称为莲华；以称为入定，以所出之男精女血称为赤白二菩提心；以将要出精而又使之持久不出时所生之乐为大乐、妙乐。对于男性的修持者而言，女性的生殖器实在就是一个修持无上瑜伽法门的道场；藉此道场的修持，可得悉地；因此，便称女子的为“婆伽曼陀罗”。
……初传密教至的莲花生，他与寂护之妹结婚，乃是无上瑜伽的实际派，也即是红教喇嘛的先驱。但是，切勿以为此等修法即是纵欲，或是淫猥。其末流之辈，自不免藉修法之名而享淫乐之实；初期的此派学者，却不是荒唐的之徒，他们既视此为最高的神圣，且亦有种种的仪轨限制。不过，此法原非出于佛教，并由于此法之实行而伤害了佛教的慧命。……
左道密教的大乐思想，是出于《金刚顶经》……此一思想的根源，它是来自印度教的性力派。根据日本崎正治的介绍，印度教的湿婆派之分支，由对于湿婆神之威力崇拜而引出生殖力崇拜及女神崇拜。湿婆的威力之中，有男女的生殖之力，生殖则由其妻担任，故而生起崇拜湿婆之妻的一派，这便是女神的性力崇拜。对于湿婆崇拜的右道派而言，于此女神的性力崇拜，便称为左道派。……
当然，原始的先民，以男女生殖之事，演为宗教的信仰，我们不应抨击其为愚蠢，如果今人而仍奉行原始先民的信仰，那就愚不可及了。
密教的真言密咒及瑜伽行法，也确有相当的效验；纵然是双身法及房中术等，也多少有些生理学上的根据。近代的中国密教学者，大多也对道教的方术深感兴趣，原因即在于它们之间，确有相通之处。
但以佛教的本质而言，唯有理解并实践四谛法，才能达成真解脱的目的；唯有实践戒定慧三无漏学及四摄六度，才是真正的成佛之道。若藉佛法之名而行外道之实，佛教岂能不亡！……
从上可知，佛教之在印度灭亡，有两大因素：一是佛教自身为了迎合印度的外道，结果也变成了与外道合流而使自己融入于印度教中。二是回教军队的屡次入侵与彻底摧毁，而使佛教没有了容身之地。
由以上所引的圣严法师所著的《印度佛教史》可知，所全盘继承的──印度的密教，其本质是套上佛法名词的外道法。如果假冒佛法的密教兴盛了，则佛教必然名存实亡。“密教兴，佛教亡”，已经为古印度的佛教历史所证明，佛门四众应时时以此惨痛之事实作为教训而警钟长鸣。
现代，对于密教的研究和批判，由于密教的书籍大量被翻译成汉语，已经远远的不是停留在表面现象的程度上了！而是从具体的法义上来进行的。密教的这些经典，并不是如某些人所说的，只有喇嘛上师才懂得！密教双身法中口诀，早就因为达赖喇嘛等上师的著作，早就解密了！而且就密教的上师如宗喀巴等所说的显教理论，也根本是违背佛理的！